М. П. Погодаева совместно с председателем комиссии по науке и образованию С. К. Процко инициировала создание Института проблем малочисленных народов Севера СО РАН.

Была одним из инициаторов создания Ассоциации «Оленеводы мира». На учредительном Конгрессе оленеводческих народов мира (1997, Надым) была избрана вице-президентом Ассоциации (до 2009); в настоящее время — советник Ассоциации.

Работала в Департаменте по делам народов и федеративным отношениям Республики Саха (Якутия), в течение 9 лет организовывала Международные семинары Ассоциации «Оленеводы мира» («Устойчивое оленеводство», «Еалат», «Еаллин» и др.), участие в международных мероприятиях представителей оленеводческих народов

из числа долган, эвенков, чукчей, юкагиров и эвенов.

Участвовала в работе Всемирной конференции женщин (Пекин, 1995), Международной конференции «Гендерное равноправие и положение женщин в Арктическом регионе» (Инари, Финляндия, 2002); представила доклад о защите традиционных знаний оленеводческих народов на 23-й сессии рабочей группы по коренным народам ООН (Женева, 2005).

Входила в состав Комиссии по государственным наградам при Президенте Республики Саха (Якутия), Координационного совета по поддержке и развитию предпринимательства при Президенте Республики Саха (Якутия). Является председателем Cоюза оленеводческих народов Республики Саха (Якутия); членом Совета по вопросам коренных малочисленных народов Севера при Главе Республики Саха (Якутия), членом правления Союза родовых общин Республики Саха (Якутия), членом экспертной группы постоянного комитета по делам Арктики и коренных малочисленных народов Севера Государственного Собрания (Ил Тумэн) Республики Саха (Якутия); глава кочевой семейно-родовой общины им. П. Е. Погодаева.